Bavaria C46 „Patagonia“ je vybavena hlavní plachtou a genou, stejně jako Bimini, Autopilot, Sprayhood, Topení, Týkový kokpit , GPS mapový plotter - kokpit.
Bavaria C46 „Patagonia“ nabízí zvláštní komfort díky následujícím prvkům vybavení: Bow thruster, Klimatizace, Polštáře do kokpitu, Invertor, Elektrické WC, Solární panely, Cockpit grill.